La iglesia de San Francisco de Paula es un templo religioso de culto católico romano bajo la advocación de San Francisco de Paula en la ciudad de La Habana.

Esta iglesia y el hospital de mujeres aledaño fueron fundados gracias a Nicolás Estèvez Borges, Rector de la Parroquial Mayor de la ciudad de San Cristóbal de La Habana y deán electo de la Santa Catedral de Santiago de Cuba, quien el 10 de diciembre de 1664 confirió poder para testar en su nombre al Sr. Obispo Don Juan de Santo Mathia Saenz de Mañozca y Murillo y al maestre de campo Francisco Dávila Orejón Gastón, dejándoles escrita una memoria con las instrucciones para revelar su testamento, lo cual estos últimos realizaron el 25 de abril de 1665 ante el escribano Don Domingo Fernández Calaza.

Con el legado del presbítero (45 002 pesos y 4 reales) y limosnas, se comenzó a construir la ermita, cuya primera piedra fue colocada el 27 de febrero de 1668, aunque se desconoce la fecha exacta de la conclusión.

Tras ser dañados los dos edificios por un temporal a fecha de 26 de septiembre de 1730, fueron reconstruidos prácticamente en su totalidad. Tras una restauración total, que tuvo lugar en el año 2000, es un lugar habitual de eventos de mùsica clàsica y de càmara.